Zymo Research công bố mã nguồn mở đường ống tin sinh học để phát hiện biến thể SARS-CoV-2 trong nước thải

TTXVN (IRVINE, California, ngày 11 tháng 5 năm 2021 /PRNewswire/ --

- Việc phát hành sớm đường ống tin sinh học VirSieve (TM) sẽ thúc đẩy sự hợp tác trong nghiên cứu SARS-CoV-2 về môi trường

Zymo Research đã phát hành mã nguồn Đường ống Tin sinh học VirSieve (TM) ( VirSieve™ Bioinformatics Pipeline ) cho cộng đồng vi sinh môi trường để thúc đẩy sự hợp tác toàn cầu và hỗ trợ phát hiện các biến thể SARS-CoV-2 trong nước thải. VirSieve (TM) là một đường ống tính toán tự động phân tích các lần đọc trình tự từ vi rút SARS-CoV-2 trong các mẫu nước thải để hiểu rõ hơn về các biến thể vi rút hiện diện trong các cộng đồng được giám sát. Bằng cách đánh giá khoảng tin cậy trong các đột biến virus được quan sát, phần mềm có khả năng tăng đáng kể độ chính xác của việc phân tích bất kỳ thay đổi nào trong vật liệu di truyền của virus.

Zymo Research releases the VirSieve™ Open-Source Bioinformatics Pipeline source code to the environmental microbiology community to promote global collaboration and support for the detection of SARS-CoV-2 variants in wastewater.

Theo Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh, trong khi việc triển khai vắc-xin đã có tác động tích cực to lớn trong việc kiềm chế đại dịch SARS-CoV-2 ở Hoa Kỳ, các chủng vi rút mới vẫn đang xuất hiện. Một số trong số các chủng này, ví dụ, B.1.1.7, được phân loại là "các biến thể cần quan tâm" do có bằng chứng về sự gia tăng khả năng lây lan, khả năng gây bệnh hoặc trốn tránh vắc xin. Xử lý nước thải theo trình tự thế hệ tiếp theo đang nổi lên như một giải pháp khả thi nhất để giám sát cộng đồng gần thời gian thực.

Việc xác định trình tự virus từ nước thải rất khó khăn do sự phân mảnh và suy thoái của RNA virus, thường dẫn đến các lỗi trình tự mà cuối cùng biểu hiện thành các đột biến giả. VirSieve (TM) có thể xác định các biến thể sai này và đánh dấu chúng là thấp hoặc không có độ tin cậy, cho phép các nhà nghiên cứu lọc các đột biến với mức độ hỗ trợ cao hơn. Zymo Research cũng cung cấp DNA / RNA Shield (TM) (DNA/RNA Shield ), thuốc thử bảo vệ RNA của vi rút khỏi bị phân hủy thêm sau khi bất hoạt bất kỳ vi rút nào để thu thập và vận chuyển mẫu nước thải an toàn, ở nhiệt độ môi trường xung quanh.

"Zymo Research trước đây đã phát triển các công cụ phần mềm công cộng như Zymo Research Transmit Program, một ứng dụng mã nguồn mở để gửi kết quả xét nghiệm COVID-19 thông qua hệ thống báo cáo sức khỏe cộng đồng CalREDIE", Tiến sĩ Michael Weinstein, Giám đốc Hệ thống Thông tin Phòng thí nghiệm và Trưởng dự án về dự án Đường ống VirSieve (TM) tại Zymo Research, cho biết. "VirSieve (TM) là một phần trong nỗ lực không ngừng của Zymo Research nhằm hỗ trợ tối đa cho các nỗ lực ứng phó với đại dịch trên toàn cầu. Chúng tôi cảm thấy VirSieve (TM) có tiềm năng không chỉ được sử dụng để theo dõi các chủng biến thể của virus SARS-CoV-2 trong nước thải cũng như các vi rút khác, vì những nỗ lực vì sức khỏe cộng đồng trong tương lai. "

"Nhận được các biến thể chính xác từ các mẫu lâm sàng hoặc nước thải là chìa khóa để xác định vị trí thích hợp của một chủng vi rút trong bối cảnh của tất cả các biến thể vi rút khác và thông báo cho các nỗ lực theo dõi mầm bệnh," Tiến sĩ Christopher Mason, một diễn giả làm việc cho Zymo Research và là đồng giám đốc của Viện dự đoán định lượng WorldQuant và là giáo sư sinh lý học và lý sinh tại Weill Cornell Medicine.

Để biết thêm thông tin về Đường ống VirSieve (TM), hãy truy cập trang web của Zymo Research ( website ) hoặc liên hệ với chúng tôi qua địa chỉ email tech@zymoresearch.com.

Giới thiệu về Zymo Research Corp.

Zymo Research là một công ty tư nhân đã phục vụ cộng đồng khoa học và chẩn đoán với các công cụ sinh học phân tử hiện đại kể từ năm 1994. "Vẻ đẹp của Khoa học là Làm cho Mọi thứ Đơn giản" là phương châm của họ, được phản ánh trong tất cả các sản phẩm của họ, từ di truyền biểu sinh đến công nghệ tinh sạch DNA / RNA. Trong lịch sử được công nhận là công ty hàng đầu trong di truyền biểu sinh, Zymo Research đang phá vỡ ranh giới với các giải pháp mới để thu thập mẫu, đo vi sinh, thiết bị chẩn đoán và công nghệ NGS có chất lượng cao và dễ sử dụng. Theo dõi Zymo Research trên Facebook (Facebook ), LinkedIn (LinkedIn ), Twitter (Twitter ), and Instagram (Instagram ).

Để biết thêm thông tin về các sản phẩm COVID-19 của Zymo Research, hãy xem các liên kết sau:

- Zymo Research phát hành phần mềm miễn phí để Streamline báo cáo kiểm tra COVID-19 ( Zymo Research Releases Free Software to Streamline COVID-19 Test Reporting )

- Zymo Research đạt được CE IVD Mark cho Bộ ghép kênh nhanh SARS-CoV-2  ( Zymo Research Obtains CE IVD Mark for its Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit )

- Zymo Research Nhận được Giấy phép Sử dụng Khẩn cấp từ FDA cho Bộ kit SARS-CoV-2 rRT-PCR nhanh của họ ( Zymo Research Obtains Emergency Use Authorization from FDA for Their Quick SARS-CoV-2 rRT-PCR Kit )

- Zymo Research nhận được CE IVD Mark cho Bộ công cụ Quick-DNA/RNA(TM) Viral MagBead của họ ( Zymo Research Receives CE IVD Mark for its Quick-DNA/RNA™ Viral MagBead Kit )

- Zymo Research ra mắt Dịch vụ giải trình tự COVID-19 để phát hiện và giám sát các biến thể SARS-CoV mới ( Zymo Research Launches COVID-19 Sequencing Service for the Detection and Surveillance of Emerging SARS-CoV-2 Variants )

- Zymo Research cung cấp tính năng Phát hiện SARS-CoV-2 và Theo dõi các biến thể trên toàn cộng đồng với Dịch vụ kiểm tra COVID-19 trong nước thải Environ(TM) ( Zymo Research Offers Community-Wide SARS-CoV-2 Detection and Variant Tracking with the Environ™ COVID-19 Wastewater Testing Service )

- Zymo Research Nhận được thanh thải 510 (k) cho Thiết bị Thu thập/Chuyển của họ cho COVID-19 ( https://www.prnewswire.com/news-releases/zymo-research-receives-510k-clearance-for-its-collectiontransport-device-for-covid-19-301245240.html?tc=eml_cleartime )

Ảnh - https://mma.prnasia.com/media2/1507133/wastewater_pr_data_on_computer_2000x1111px.jpg?p=medium600  

Logo - https://mma.prnasia.com/media2/364743/Zymo_Research_Corp_Logo.jpg?p=medium600